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恐らく関数ポインタを追加していないからじゃないでしょうか。
弾幕の関数は似たような関数が大量に出てくるので、
ポインタでその関数をさせるようにしてあります。
例えば感覚的に表現するならば

int *p[4];

p[0]=弾幕0の関数のポインタ;
p[1]=弾幕1の関数のポインタ;
p[2]=弾幕2の関数のポインタ;
p[3]=弾幕3の関数のポインタ;

と格納しておけば、3番の弾幕の処理をさせたいときp[処理をさせたい番号=3]を示せばいい事になり
楽が出来ます。
その為、新しく弾幕4を追加した時は

int *p[5];

p[0]=弾幕0の関数のポインタ;
p[1]=弾幕1の関数のポインタ;
p[2]=弾幕2の関数のポインタ;
p[3]=弾幕3の関数のポインタ;
p[4]=弾幕4の関数のポインタ;

のように新しく追加しなければなりません。

これをやってみましょう。

shot.cppファイルの上に

extern void shot_bullet_H000(int);
extern void shot_bullet_H001(int);
extern void shot_bullet_H002(int);
extern void shot_bullet_H003(int);
extern void shot_bullet_H004(int);
extern void shot_bullet_H005(int);
extern void shot_bullet_H006(int);

と長々と書いているところがありますね。
もし今007をshotH.cppに追加したのならば、上の続きに

extern void shot_bullet_H007(int);

を追加して下さい。そして上で言う
p[4]=弾幕4の関数のポインタ;
の作業をしてやります。

void (*shot_bullet[SHOT_KND_MAX])(int) ={
	shot_bullet_H000,
	shot_bullet_H001,
	shot_bullet_H002,
	shot_bullet_H003,
	shot_bullet_H004,
	shot_bullet_H005,
	shot_bullet_H006,
};

これがそのポインタの格納ですから

void (*shot_bullet[SHOT_KND_MAX])(int) ={
	shot_bullet_H000,
	shot_bullet_H001,
	shot_bullet_H002,
	shot_bullet_H003,
	shot_bullet_H004,
	shot_bullet_H005,
	shot_bullet_H006,
	shot_bullet_H007,
};

を追加して下さい。この時SHOT_KND_MAXが
上限を超えていないか注意して下さい。
例えば今の場合は8以上になっている事を確認して下さい。

もしこれで解決しない場合はまたお聞き下さい。

//1発だけ、自機に向かって直線発射
void shot_bullet_H000(int n){
        int k;
        if(shot[n].cnt==0){
                if(shot[n].flag!=2 && (k=shot_serch(n))!=-1){  //←ここでエラーが起きたらしいです。
                        shot[n].bullet[k].knd   =enemy[shot[n].num].blknd2;
                        shot[n].bullet[k].angle =shotatan2(n);
                        shot[n].bullet[k].flag  =1;
                        shot[n].bullet[k].x     =enemy[shot[n].num].x;
                        shot[n].bullet[k].y     =enemy[shot[n].num].y;
                        shot[n].bullet[k].col   =enemy[shot[n].num].col;
                        shot[n].bullet[k].cnt   =0;
                        shot[n].bullet[k].spd   =3;
                        se_flag[0]=1;
                }
        }
}

警告はこちらでもでますよ。理由はよく知りませんが・・。
保存して、閉じて、また開いて、保存した時の状態になっていれば、
無事保存できている事が確認できると思います。

(これから何か途中わからない事があれば言って下さい)

これからする作業は本来反対からするべきですが、順番がわからなくなってはいけないので、
最初から書きますね。(1)～(4)でそれぞれ値がきちんとはいっているか確認してください。


(1)
まず、エクセルデータにおいて、弾幕種類(blknd)にあたるのが弾幕の番号ですね。
これはload.cppのload_story()にて

case 7:	enemy_order[n].blknd	=atoi(inputc);break;

でenemy_order[*].blkndに読み込まれます。
この時ちゃんと7が入っているかブレイクポイントを用いて確認して下さい。
(printfDxでもいいですが)


(2)
このデータは敵が出現する時刻になったらenemy_enter()関数内で

enemy[*].blkndに格納されるはずです。

またここに7が入っていることを確認して下さい。


(3)
そしてenemy.cpp内のenter_shot(int)関数内で

void enter_shot(int i){
	int j;
	for(j=0;j<SHOT_MAX;j++){//フラグのたって無いenemyを探す
		if(shot[j].flag==0){//未使用の弾幕データがあれば
			memset(&shot[j],0,sizeof(shot_t));//初期化して登録
			shot[j].flag=1;//フラグをたてる
			shot[j].knd=enemy.blknd;//弾の種類

shot[j].kndに7が渡されます。
ここも確認してください。


(4)
後は、shot.cpp内の

void shot_main(){
	int i;
	for(i=0;i<SHOT_MAX;i++){//弾幕データ計算
		//フラグが立っていて、設定した種類が間違っていなければ(オーバーフロー対策)
		if(shot.flag!=0 && 0<=shot.knd && shot.knd<SHOT_KND_MAX){
			shot_bullet[shot.knd](i);//.kndの弾幕計算関数を呼ぶ関数ポインタ

shot.kndが7なら
shot_bullet[shot.knd](i)で
配列の[7]が呼ばれるはずですからenemy_pattern7が呼ばれるはずです。
ここも確認してください。

これらが全てうまくいっていて、それでも、弾幕7が実行されないのなら、
アドバイスだけでは解りませんので、こちらに送って下さい。