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インベーダーゲームにカウントダウンをつけたいのですがどうすればいいのですか？

Cファイル一つとHeaderファイル一つという簡単なものです

どうすればいいですか？では何が分からないのか分かりません。それとも丸投げでしょうか？

DXライブラリやらboostやら、標準でサポートされているものでも、
タイマーがあります。それを使えばなんとかなりますよ。

一応、DXライブラリには　GetNowCount　という関数があって、ウインドウが起動されてからの時間を知ることができます。それをうまく使ってください。
DXライブラリの関数の一覧がこのページに載せられているので、暇なときにでも眺めてみれば今後のためになりますよ。